Am 1. Februar 1999 gründete Markus Fischer die Firma Auto Fischer im Industriegebiet Längmatt in St. Erhard. Nach einmonatiger Vorbereitung konnte er am 1. März die Eröffnung feiern. Ein langersehnter Traum ging in Erfüllung. Er spezialisierte sich für Reparaturen und Service aller Marken. Da er bis zur Firmengründung auf verschiedenen Automarken gearbeitet hat, konnte er sehr viel Erfahrung sammeln.
Auch sein Hobby, nämlich die Freude an den alten VW Busse konnte er nun einbringen. Der nächste Schritt war die Übernahme der Marke Daihatsu der Emil Frey – Gruppe im August 2001. Daihatsu gehört der Marke Toyota und ist der älteste Automobilhersteller Japans.
Um die Neuwagen und Occasionen noch schöner präsentieren zu können entstand im Juni 2002 entlang der Hauptstrasse ein neuer Ausstellungsplatz.
Im Jahre 2013 endete die Zusammenarbeit mit der Marke Daihatsu. Aus finanziellen Gründen wurden keine Fahrzeuge mehr nach Europa exportiert.
Im gleichen Jahr besuchte er diverse Kurse. Zum Beispiel bei der Firma Reimo (Schlafdächer) und Eberspächer (Standheizungen). Diese werden heute fachgerecht eingebaut.